乙型肝炎病毒(HBV)屬嗜肝DNA病毒科(hepadnaviridae)，基因組長約3.2kb，為部分雙鏈環(huán)狀DNA。

　　HBV侵入人體后，與肝細胞膜上的受體結(jié)合，脫去包膜，穿入肝細胞質(zhì)內(nèi)，然后脫去衣殼，部分雙鏈環(huán)狀HBV DNA進入肝細胞核內(nèi)，在宿主酶的作用下，以負鏈DNA為模板延長正鏈，修補正鏈中的裂隙區(qū)，形成共價閉合環(huán)狀DNA (cccDNA)，然后以cccDNA為模板，在宿主RNA聚合酶II的作用下，轉(zhuǎn)錄成幾種不同長短的mRNA，其中3.5kb的mRNA含有HBV DNA序列上全部遺傳信息，稱為前基因組RNA。后者進入肝細胞質(zhì)作為模板，在HBV逆轉(zhuǎn)錄酶作用下，合成負鏈DNA；再以負鏈DNA為模板，在HBV DNA聚合酶作用下，合成正鏈DNA，形成子代的部分雙鏈環(huán)狀DNA，最后裝配成完整的HBV，釋放至肝細胞外。胞質(zhì)中的子代部分雙鏈環(huán)狀DNA也可進入肝細胞核內(nèi)，再形成cccDNA并繼續(xù)復制。cccDNA半壽(衰)期長，很難從體內(nèi)徹底清除[1, 2]。

　　HBV含４個部分重疊的開放讀碼框(ORF)，即前S／S區(qū)、前C／C區(qū)、P區(qū)和X區(qū)。前S/S區(qū)編碼大(前S1、前S2及S)、中(前S2及S)、小(S) 3種包膜蛋白；前C/C區(qū)編碼HBeAg及HBcAg；P區(qū)編碼聚合酶；X區(qū)編碼X蛋白。前C區(qū)和基本核心啟動子(BCP)的變異可產(chǎn)生HBeAg陰性變異株。前C區(qū)最常見的變異為G1896A點突變，形成終止密碼子(TAG)，不表達HBeAg。BCP區(qū)最常見的變異是A1762T/G1764A聯(lián)合點突變，選擇性地抑制前C mRNA的轉(zhuǎn)錄，降低HBeAg合成[3]。

　　P基因變異主要見于POL/RT基因片段(349~692 aa，即rt1~rt344)。在拉米夫定治療中，最常見的是酪氨酸-蛋氨酸-天門冬氨酸-天門冬氨酸(YMDD)變異，即由YMDD變異為YIDD (rtM204I)或YVDD (rtM204V)，并常伴有rtL180M變異，且受藥物選擇而逐漸成為對拉米夫定耐藥的優(yōu)勢株[4] (Ⅰ)。S基因變異可導致隱匿性HBV感染(occult HBV infection)，表現(xiàn)為血清HBsAg陰性，但仍可有HBV低水平復制(血清HBV DNA常< 104拷貝/ml)[5]。
　　根據(jù)HBV全基因序列差異≥8%或S區(qū)基因序列差異≥4%，目前HBV分為A~H 8個基因型。各基因型又可分為不同基因亞型。A基因型慢性乙型肝炎患者對干擾素治療的應答率高于D基因型，B基因型高于C基因型；A和D基因型又高于B和C基因型[6] (Ⅰ)。基因型是否影響核苷(酸)類似物的療效尚未確定。

　　HBV易發(fā)生變異。在HBV感染者體內(nèi)，常形成以一個優(yōu)勢株為主的相關(guān)突變株病毒群，稱為準種(quasispecies)，其確切的臨床意義有待進一步證實。HBV的抵抗力較強，但65℃10 h、煮沸10 min或高壓蒸氣均可滅活HBV。含氯制劑、環(huán)氧乙烷、戊二醛、過氧乙酸和碘伏等也有較好的滅活效果。